การแพ้อาหารเกิดขึ้นเมื่อร่างกายมีปฏิกิริยาต่ออาหารอย่างไม่เหมาะสมราวกับว่าเป็นภัยคุกคาม เช่น แบคทีเรียหรือไวรัส ซึ่งหมายความว่าระบบภูมิคุ้มกันจะตอบสนองต่อระบบภูมิคุ้มกันและทำให้เกิดปฏิกิริยาขึ้น ปฏิกิริยาภูมิแพ้อาจมีความรุนแรงแตกต่างกันไป แพ้อาหาร ตั้งแต่ทำให้เกิดอาการท้องร่วงเล็กน้อยไปจนถึงปฏิกิริยาภูมิแพ้ที่คุกคามถึงชีวิต โชคดีที่การแพ้แบบภูมิแพ้ในสัตว์เลี้ยงนั้นต่างจากโรคภูมิแพ้ในมนุษย์ซึ่งพบได้น้อยมาก การแพ้อาหารที่แท้จริงนั้นแตกต่างจากการแพ้อาหาร การแพ้อาหารก็เป็นปฏิกิริยาต่ออาหารบางชนิดเช่นกัน แต่ไม่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกัน แม้ว่าอาการจะคล้ายกัน แต่ก็มีแนวโน้มที่จะรุนแรงขึ้น